El Consejo Ejecutivo de la AMMEF A.C. (Asociación Mexicana de Médicos en Formación) es el órgano de dirección encargada de la gestión estratégica, administración, representación oficial y coordinación general de la asociación, tanto a nivel Nacional como dentro de cada Comité Local.

Su función principal es velar por el cumplimiento de los planes de trabajo, coordinar a los oficiales y directores de las distintas áreas, resguardar el estatus legal y la salud organizacional, y servir de enlace entre el estudiantado, la universidad y la estructura nacional de la AMMEF A.C.